LabDAO plāno atklātā pirmkoda AI nākotni narkotiku atklāšanai

Projekts Folding@home COVID-19 pandēmijas laikā kļuva par ziņu virsrakstiem par neizmantotās skaitļošanas jaudas izmantošanu, lai izpētītu proteīnu salokāmo meklēšanas telpu, lai cīnītos pret jauno koronavīrusu. Dodot pilsoņiem iespēju būt pašiem par zinātniekiem, iniciatīva veica liela mēroga dažādu proteīnu molekulāro konfigurāciju simulācijas izkliedētā “reģistrēto” datoru tīklā visā pasaulē.

Šī decentralizētā paradigma tika pasludināta, lai apvienotu cilvēkus kopīgas problēmas risināšanai un efektīvi piesaistītu skaitļošanas jaudu, bet kā būtu, ja skaitļošanas jauda un problēmu risināšanas infrastruktūra tiktu apgriezti pretēji? Citiem vārdiem sakot, kā būtu, ja indivīdi varētu vadīt savus projektus, izmantojot uzkrāto skaitļošanas jaudu un bioloģisko eksperimentu rīki, lai palaistu?

LabDAO šo sapni padara par realitāti, izmantojot savu PLEX platformu. PLEX ir atvērtā pirmkoda komandrindas rīks, kas izstrādāts, lai padarītu pieejamus ne tikai skaitļošanas resursus, bet arī dažādus bioloģiskās-mašīnmācīšanās rīkus (izveidots LabDAO ietvaros “BioML” komplekts), kas ir pieejams dažādos apstākļos. Neatkarīgi no tā, vai eksperimentē ar mazu molekulu dokstaciju vai pašu proteīnu locīšanas simulācijām, PLEX ļauj lietotājiem piekļūt LabDAO rīku bibliotēkai, koplietot rezultātus un vizualizēt tos mazāk nekā piecās minūtēs.

Šis rīku komplekts un tā lietošanu veicinošā platforma tika izstādīta Zuzalu samitā Blockchain Meets Biology aprīļa sākumā, kur LabDAO galvenās komandas locekle Lilija Hansena-Gillisa no sākuma līdz beigām demonstrēja iekšējās molekulārās dinamikas simulāciju. proteīnu, lai atrastu tā visstabilāko konfigurāciju. Pēc tam kā pašpārliecināta “nekodētāja” viņa iepazīstināja auditoriju no sākuma līdz beigām — ar datoru, WiFi, PLEX komandrindā un neko vairāk.

Plašāk runājot, LabDAO ir Web3 iespējota decentralizēta platforma (daļa no lielākās “DeSci” kustības), kuras mērķis ir radīt produktīvāku vidi ar atvērtā koda darbināmām zālēm. Padarot vismodernākos rīkus un resursus pieejamus plašākai ekosistēmai, LabDAO mērķis ir izveidot piemērotu vidi pārredzamiem un pieejamiem zinātnes sasniegumiem. Neatkarīgi no tā, vai pētniekiem nav vajadzīga sava aparatūra vai skaitļošanas infrastruktūra vai eksperimentu rezultāti tiek publicēti blokķēdes virsgrāmatā tā, lai tie būtu izsekojami un reproducējami, organizācija ir apņēmusies, sadarbojoties, padarīt iespējamu vairāk inovāciju — nojaucot šķēršļus, ko rada nabadzīga situācija. lietojamība un nišas zināšanas.

LabDAO centieni veidot šo DeSci nākotnes pasauli šodienai nesen saņēma stimulu 3.6 miljonu ASV dolāru finansējuma veidā no dažādiem citiem DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan un citiem. Šis atbalsta pieplūdums veicinās pastāvīgos centienus izveidot atvērtā pirmkoda programmatūras rīkus un nostiprināt LabDAO pētniecības ekosistēmu.

Kas attiecas uz pašu PLEX, tuvākie nākamie soļi horizontā ietver platformas testēšanu dažādās zinātniskās sadarbībās, dažādu rīku konteineru ievietošanu un nepieciešamās aparatūras uzkrāšanu BioML tīkla veicināšanai.

Kas attiecas uz ilgtermiņa perspektīvu, iespējams, nākamās dzīvības glābšanas zāles nākamā lielā infekcijas slimības uzliesmojuma laikā tiks izstrādātas ar PLEX jaudu, decentralizētu soli uz priekšu vienlaikus. Tā kā ekosistēma turpina augt, laiks rādīs.

Paldies Aishani Aatresh papildu pētījumiem un ziņojumiem par šo rakstu. Esmu SynBioBeta dibinātājs, un daži uzņēmumi, par kuriem rakstu, ir šī uzņēmuma sponsori SynBioBeta konference. Lai iegūtu vairāk satura, varat abonēt mans iknedēļas biļetens.